Bien que la Mongolie ne demande pas de vaccins obligatoires, il est fortement recommandé de s'assurer que les vaccins couramment administrés dans les pays occidentaux (tétanos, diphtérie, poliomyélite, typhoïde) sont à jour. Les vaccins contre l'hépatite A et B sont également fortement recommandés, surtout pour les voyages hors des zones urbaines où l'accès aux soins peut être limité.